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Dynamische Programmierung: Needleman-Wunsch-Algorithmus, Earley-Algorithmus, Hir

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Commentaires du vendeur
“Gepflegter, sauberer Zustand. Außen: Angestoßen.”
Produktart
Bücher
ISBN-10
1158941609
Buchtitel
Dynamische Programmierung
Untertitel
Needleman-Wunsch-Algorithmus, Earley-Algorithmus,
Autor
Unbekannt
Erscheinungsjahr
November 2011
Format
Taschenbuch
Länge
246 cm
Breite
189 cm
Höhe
1 cm
Gewicht
70 g
EAN
9781158941605

À propos de ce produit

Produktinformation

Quelle: Wikipedia. Seiten: 24. Kapitel: Needleman-Wunsch-Algorithmus, Earley-Algorithmus, Hirschberg-Algorithmus, Levenshtein-Distanz, Zuker-Algorithmus, Baeza-Yates-Gonnet-Algorithmus, Cocke-Younger-Kasami-Algorithmus, Smith-Waterman-Algorithmus, Nussinov-Algorithmus, Rucksackproblem, Viterbi-Algorithmus, Bellman-Algorithmus, Gotoh-Algorithmus, Algorithmus von Floyd und Warshall, Matrix-Kettenmultiplikation, Dynamic-Time-Warping, Optimalitätsprinzip von Bellman, Forward-Algorithmus, Sankoff-Algorithmus, Backward-Algorithmus. Auszug: Der Needleman-Wunsch-Algorithmus ist ein Verfahren der Bioinformatik. Er wird für den Vergleich zweier Sequenzen (häufig zweier DNA- oder Aminosäuresequenzen) genutzt. Hierfür ermittelt er das globale Alignment, d. h. eine Zuordnung der Teilbereiche einer der Sequenzen auf möglichst ähnliche Bereiche der anderen, und eine Bewertung der Gesamtähnlichkeit, den global optimalen Similarity-Score. Er verwendet die Methode der dynamischen Programmierung. Der Needleman-Wunsch-DP-Algorithmus berechnet in einer Matrix für alle Paare von möglichen Präfixen der Sequenzen a und b den optimalen globalen Similarity-Alignment-Score. Das Element der Matrix enthält den optimalen Score für das optimale globale Alignment der Teilsequenz von a und von b. Die Schreibweise entspricht dem i-ten Praefix von a. Wenn m die Sequenzlänge von a bzw. n die Sequenzlänge von b bezeichnet, dann enthält die Score-Matrix M Zeilen und Spalten. Der Alignment-Score der vollständigen Sequenzen ist nach der Ausführung des Algorithmus in enthalten. Die Score-Matrix wird rekurrent berechnet. Für das Element (i,j) der Matrix M wird über drei Fälle maximiert. Die Erweiterung des bisherigen Alignments der Sequenzen und um ein Match bzw. Mis-Match, entspricht der Addition des zuvor berechneten Scores aus und der Kosten für die Ersetzung von zu . Die Erweiterung eines schon berechneten Aligments um eine abschließende Löschung, entspricht der Addition der allgemeinen Gap-Kosten der Länge der Löschung zu dem Score des optimalen Alignments der Sequenzen und , wobei die Länge der Löschung bezeichnet. Analog zur Löschung entspricht die Erweiterung eines optimalen Alignments der Sequenzen und um eine abschließende Einfügung der Addition des Scores dieses Alignments und der Gap-Kosten für die Länge der Einfügung. Der maximale Wert dieser drei Alternativen wird im Element gespeichert. Die Gap-Kostenfunktion kann allgemein sein. D.h. es wird nicht vorausgesetzt, dass einheitliche Kosten oder Affine-Gap-Kosten verwendet w

Produktkennzeichnungen

Herausgeber
QUELLE: Wikipedia
ISBN-10
1158941609
ISBN-13
9781158941605
eBay Product ID (ePID)
24041409318

Produkt Hauptmerkmale

Verlag
Books Llc, Reference Series
Ausgabejahr
2011
Sprache
Deutsch
Zeitschriftentitel
Dynamische Programmierung

Zusätzliche Produkteigenschaften

Anzahl der Seiten
24 Seiten
Format
Taschenbuch
Hörbuch
No
Inhaltsbeschreibung
Paperback
Item Height
1mm
Autor
Quelle: Wikipedia
Item Length
24cm
Item Width
18cm
Item Weight
70g

Description de l'objet fournie par le vendeur

Informations sur le vendeur professionnel

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